• Ciencia pesquera.
• Técnicas de dibujo para ingenieros pesqueros.
• Ingeniería en sistemas de producción pesquera y acuícola.
• Interacción de factores en sistemas de producción.

• Ordenamiento Ribereño en el Estado de Nayarit y Bahía de Banderas. Financiado por la Comisión Nacional de Acuacultura y Pesca.
• Efecto del cambio climático en la pesca y la acuacultura en el Pacífico mexicano. Red de Estudios Pesqueros y Acuícolas (UAN-UAS-CIBNOR). Financiado por el Programa para el Desarrollo Profesional Docente (PRODEP-SEP) en la Convocatoria 2015 de Integración de Redes Temáticas de Colaboración Académica.
• Cultivo superintensivo de camarón blanco (Litopenaeus vannamei) en geomembranas circulares. Registrado en la UAN con financiamiento externo.

Sistema Nacional de Investigadores (SNI-Conacyt) Nivel I

Maestro Perfil Deseable (PRODEP-SEP).

Castillo-Vargasmachuca S.G., Ponce-Palafox J.T., Chávez-Ortiz E., Arredondo-Figueroa J.L. (2007). Effect of the inicial stocking body weight on growth of spotted rose snapper Lutjanus guttatus (Steindachner, 1869) in marine floating cages. Revista de Biología Marina y Oceanografía. 42(3):261-267. ISSN 0718-1957 (electrónico) 0717-3326 (impreso). Disponible en: http://www.revbiolmar.cl/resumenes/v423/423-261.pdf.

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C. Vargas-Machuca, J. T. Ponce-Palafox, J. L. Arredondo-Figueroa, E. A. Chávez-Ortiz, E. J. Vernon-Carter. (2008). Physico-chemical water parameters variation in the floating cages of snappers (Lutjanus peru and L. guttatus) farmed in tropical sea. Revista Mexicana de Ingeniería Química. 7(3):237-242. ISSN 1665-2738. Disponible en: http://www.scielo.org.mx/pdf/rmiq/v7n3/v7n3a8.pdf

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Castillo-Vargasmachuca, J. T. Ponce-Palafox, M. García-Ulloa, J. L. Arredondo-Figueroa, A. Ruiz-Luna, E. A. Chávez & A. G. Tacon. (2012). Effect of Stocking Density on Growth Performance and Yield of Subadult Pacific Red Snapper Cultured in Floating Sea Cages. North American Journal of Aquaculture. 74(3):413-418. ISSN: 1522-2055(Print) 1548-8454(Online). Disponible en: http://www.tandfonline.com/doi/abs/10.1080/15222055.2012.676002

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Castillo-Vargasmachuca S., J. T. Ponce-Palafox, J. L. Arredondo-Figueroa, M. García-Ulloa, A. Benítez-Valle, L. Martínez-Cárdenas, D. Puga-López, A. Seidavi 2015. The effect of Yucca schidigera liquid extract on water quality and survival of Pacific red snapper Lutjanus peru during acclimatization. Archivos de Medicina Veterinaria. 47(1):107-109. ISSN 0301-732X (Impresa) 0717-6201 (en línea). Disponible en: http://www.veterinaria.uach.cl/archivos_med_vet/wp-content/uploads/publications/1a0b17_S-Castillo-Vargasmachuca-JT-Ponce-Palafox-JL-Arredondo-Figueroa-M-Garc%C3%ADa-Ulloa-A-Ben%C3%ADtez-Valle-L-Mart%C3%ADnez-C%C3%A1rdenas-D-Puga-L%C3%B3pez-A-Seidavi.pdf

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Sergio G. Castillo-Vargasmachuca, Jesús T. Ponce-Palafox, Eulalio Arámbul-Muñoz, Guillermo Rodríguez-Domínguez & Eugenio Alberto Aragón-Noriega. 2018. The spotted rose snapper (Lutjanus guttatus Steindachner 1869) farmed in marine cages: review of growth models. Reviews in Aquaculture. Vol. 10(2):376-384. ISSN (online):1753-5131, ISSN (print):1753-5123. Disponible en: https://onlinelibrary.wiley.com/toc/17535131/2018/10/2

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